猫品种的鉴定方法及装置

1.本技术涉及品种鉴定技术领域，特别涉及猫品种的鉴定方法。本技术同时涉及猫品种的鉴定装置，一种计算设备，以及一种计算机可读存储介质。


背景技术：

2.随着大家生活水平的提高，精神生活也逐渐被需求，越来越多的人因为猫的温顺、可爱而喜爱猫，因此，对猫品种的鉴定需求也越来越多，纯种猫的消费市场越来越大。
3.对于猫品种的鉴定，通常是通过猫的品种特征，如英短的圆脸以及粗短的四肢，布偶猫蓝色的眼睛，折耳猫向前折叠的耳朵，加菲猫的扁平的鼻子等等，另外，还可以通过毛发颜色进行鉴定，例如蓝猫的毛发是灰蓝色、虎斑猫身上的毛发像老虎身上的花纹，用户在纯种猫的花费越来越高，仅凭观察确定品种，已经无法和高价值的花费匹配，因此，继续一种更客观准确的猫品种鉴定方法来进行猫品种的鉴定。


技术实现要素：

4.有鉴于此，本技术实施例提供了猫品种的鉴定方法。本技术同时涉及低密度猫品种鉴定snp芯片的设计方法、猫品种的鉴定装置，一种计算设备，以及一种计算机可读存储介质，以解决现有技术中存在的上述问题。
5.根据本技术实施例的第一方面，提供了一种猫品种的鉴定方法，包括：
6.采集待鉴定猫的基因信息；
7.基于低密度猫品种鉴定snp芯片对所述基因信息进行检测，获得所述基因信息对应的基因检测结果，其中，所述低密度猫品种鉴定snp芯片根据多个猫品种的snp信息设计生成；
8.根据所述基因检测结果确定所述待鉴定猫的目标品种信息。
9.根据本技术实施例的第二方面，提供了一种低密度猫品种鉴定snp芯片的设计方法，包括：
10.创建基于猫品种的snp位点库；
11.基于基因组关联分析工具集在所述snp位点库中确定多个鉴定snp位点，其中，所述多个鉴定snp位点用于鉴别猫品种；
12.根据各鉴定snp位点制作低密度猫品种鉴定snp芯片。
13.根据本技术实施例的第三方面，提供了一种猫品种的鉴定装置，包括：
14.采集模块，被配置为采集待鉴定猫的基因信息；
15.检测模块，被配置为基于低密度猫品种鉴定snp芯片对所述基因信息进行检测，获得所述基因信息对应的基因检测结果，其中，所述低密度猫品种鉴定snp芯片根据多个猫品种的snp信息设计生成；
16.鉴定模块，被配置为根据所述基因检测结果确定所述待鉴定猫的目标品种信息。
17.根据本技术实施例的第四方面，提供了一种计算设备，包括存储器、处理器及存储
在存储器上并可在处理器上运行的计算机指令，所述处理器执行所述计算机指令时实现所述猫品种的鉴定方法或低密度猫品种鉴定snp芯片的设计方法的步骤。
18.根据本技术实施例的第五方面，提供了一种计算机可读存储介质，其存储有计算机指令，该计算机指令被处理器执行时实现所述猫品种的鉴定方法或低密度猫品种鉴定snp芯片的设计方法的步骤。
19.本技术提供的猫品种的鉴定方法，采集待鉴定猫的基因信息；基于低密度猫品种鉴定snp芯片对所述基因信息进行检测，获得所述基因信息对应的基因检测结果，其中，所述低密度猫品种鉴定snp芯片根据多个猫品种的snp信息设计生成；根据所述基因检测结果确定所述待鉴定猫的目标品种信息。
20.本技术一实施例实现了在对猫品种进行鉴定的过程中，在采集了猫的基因信息后，使用低密度猫品种鉴定snp芯片即可对该基因信息进行检测，通过低密度猫品种鉴定snp芯片对待鉴定猫进行鉴定，提高了鉴定准确率，用较少密度的snp位点对待鉴定猫进行鉴定，同时还能有效降低检测成本。
附图说明
21.图1是本技术一实施例提供的一种猫品种的鉴定方法的流程图；
22.图2是本技术一实施例提供的一种低密度猫品种鉴定snp芯片的设计方法的流程图；
23.图3是本技术一实施例提供的实施例提供的验证分类示意图；
24.图4是本技术一实施例提供的一种猫品种的鉴定装置的结构示意图；
25.图5是本技术一实施例提供的一种计算设备的结构框图。
具体实施方式
26.在下面的描述中阐述了很多具体细节以便于充分理解本技术。但是本技术能够以很多不同于在此描述的其它方式来实施，本领域技术人员可以在不违背本技术内涵的情况下做类似推广，因此本技术不受下面公开的具体实施的限制。
27.在本技术一个或多个实施例中使用的术语是仅仅出于描述特定实施例的目的，而非旨在限制本技术一个或多个实施例。在本技术一个或多个实施例和所附权利要求书中所使用的单数形式的“一种”、“所述”和“该”也旨在包括多数形式，除非上下文清楚地表示其他含义。还应当理解，本技术一个或多个实施例中使用的术语“和/或”是指并包含一个或多个相关联的列出项目的任何或所有可能组合。
28.应当理解，尽管在本技术一个或多个实施例中可能采用术语第一、第二等来描述各种信息，但这些信息不应限于这些术语。这些术语仅用来将同一类型的信息彼此区分开。例如，在不脱离本技术一个或多个实施例范围的情况下，第一也可以被称为第二，类似地，第二也可以被称为第一。取决于语境，如在此所使用的词语“如果”可以被解释成为“在
……
时”或“当
……
时”或“响应于确定”。
29.需要说明的是，本技术所涉及的用户信息(包括但不限于用户设备信息、用户个人信息等)和数据(包括但不限于用于分析的数据、存储的数据、展示的数据等)，均为经用户授权或者经过各方充分授权的信息和数据，并且相关数据的收集、使用和处理需要遵守相
关国家和地区的相关法律法规和标准，并提供有相应的操作入口，供用户选择授权或者拒绝。
30.首先，对本技术一个或多个实施例涉及的名词术语进行解释。
31.snp：单核苷酸多态性，单核苷酸多态性主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的dna序列多态性。它是人类可遗传的变异中最常见的一种，占所有已知多态性的90％以上。snp在人类基因组中广泛存在，平均每300个碱基对中就有1个，估计其总数可达300万个甚至更多。snp是一种二态的标记，由单个碱基的转换或颠换所引起，也可由碱基的插入或缺失所致。snp既可能在基因序列内，也可能在基因以外的非编码序列上。
32.snp芯片：snp生物芯片，snp芯片是指基因组水平上由单个核苷酸变异引起的dna序列多态性。snp芯片的检测通量很大，一次可以检测几十万到几百万个snp位点，检测准确率可以达到99.9％，检测费用相对较低。
33.目前对于猫品种的鉴定，通常是通过猫的品种特征，例如英短的圆脸以及粗短的四肢，布偶猫蓝色的眼睛，折耳猫向前折叠的耳朵，加菲猫的扁平的鼻子等等，另外，还可以通过毛发颜色进行鉴定，例如蓝猫的毛发是灰蓝色、虎斑猫身上的毛发像老虎身上的花纹，用户在纯种猫的花费越来越高。目前还有一种是对猫品种的基因检测，但是基因检测的成本花费较高。
34.snp也称单核苷酸多态芯片检测技术，snp具有已知性、可遗传性、可检测性，可用于疾病基因的定位、克隆和鉴定，寻找疾病相关的突变位点，同时，snp芯片具有价格低廉，检测快速的优点。
35.基于此，在本技术中，提供了猫品种的鉴定方法。本技术同时涉及低密度猫品种鉴定snp芯片的设计方法、猫品种的鉴定装置，一种计算设备，以及一种计算机可读存储介质，在下面的实施例中逐一进行详细说明。
36.图1示出了根据本技术一实施例提供的一种猫品种的鉴定方法的流程图，具体包括以下步骤：
37.步骤102：采集待鉴定猫的基因信息。
38.其中，待鉴定猫具体是指需要判断品种的猫，在本技术提供的方法中，是对猫的品种进行鉴定，例如，鉴定猫是否为纯种的伯曼猫、加菲猫、折耳猫等等。
39.基因信息具体是指该待鉴定猫的dna(脱氧核糖核酸)信息，在实际应用中，每只猫的dna信息都是独一无二的，通过采集待鉴定猫的dna信息，后续再对dna信息进行比对分析，即可确定该待鉴定猫的品种信息。
40.具体的，采集待鉴定猫的基因信息，包括：
41.采集待鉴定猫的生物检材；
42.在所述生物检材中提取所述待鉴定猫的基因信息。
43.在实际应用中，待鉴定猫的dna信息存在于其生物检材中，生物检材可以理解为有生命的动植物的组成全部及部分残留的痕迹，可以是血液、体液、毛发等等携带有dna信息的检材。在获得生物检材之后，即可在生物检材中提取该待鉴定猫的基因信息。
44.在本技术提供的一具体实施方式中，以生物检材为血液为例，提取待鉴定猫的全血，在样本采集过程中，为了保证dna的稳定，采集到的待鉴定猫的全血加入肝素纳血液抗凝剂，并将采血管置于液氮罐中保存，回到实验室后，按照dna保存全液：全血(1:3)的比例
转入特定的样本保存管中-80℃保存。再采用苯酚-氯仿-异戊醇抽提法进行全血dna的提取，从而获得待鉴定猫的基因信息。
45.在本技术提供的另一具体实施方式中，以生物检材为待鉴定猫的口腔拭子为例，采集待鉴定猫的口腔拭子，并将采集到的口腔拭子放入到待检测试管中，对采集到的口腔拭子采用离心或积压的方式使得样本满足实验要求(至少1毫升)。
46.再对样本进行核酸提取，提取方式采用双板法提取，不同之处为eb板内洗脱液为70ul超纯水，便于后续样本浓度低需要浓缩处理，提取完的样本暂存与4℃冰箱直至下机。在实际应用中，对样本的dna浓度定量测定，当浓度大于17.2ng/nl的情况下，可以进行后续实验，当浓度处于17.2ng/ul-6ng/ul的区间时，考虑浓缩后进入后续实验，当浓度小于6ng/ul时，需重新采样。
47.步骤104：基于低密度猫品种鉴定snp芯片对所述基因信息进行检测，获得所述基因信息对应的基因检测结果，其中，所述低密度猫品种鉴定snp芯片根据多个猫品种的snp信息设计生成。
48.其中，低密度猫品种鉴定snp芯片具体是指专用于根据猫的基因信息进行品种鉴定的snp芯片，snp芯片将大量的探针分子固定在支持物上，然后与标记的样本分子进行杂交，通过检测每个探针分子的杂交信号强度，进而获得原本分子的数量和序列信息，通俗来讲，就是通过微加工，将数以万计的特定序列的dna片段(基因探针)，有规律的排列固定在硅片、玻片等支持物上，构成一个二维的探针阵列，snp芯片主要用于基因检测。在本技术提供的方法中，低密度猫品种鉴定snp芯片是预先根据多个已知猫品种的snp信息设计生成的。
49.在本技术提供的方法中，snp芯片上有多个探针，在每个探针上设置有一个引物对，探针上的引物对是预先设置好的，每个探针应一个基因位点，当待鉴定猫的基因信息被探针捕获到之后，探针的引物对信息就会与基因信息里的对应基因位点的上游基因片段和下游基因片段进行匹配，从而确定对应的snp位点，进而提取出基因位点的基因型信息，从而实现获得基因检测结果的目的。
50.在实际应用中，snp芯片的探针数量可以有几万、几十万、甚至几百万，在本技术中，对snp芯片的规格不做限定，设计好的snp芯片可以对已经做过测试实验的猫的品种进行鉴定，但是在实际应用中，一个snp芯片只可以鉴定一只待鉴定猫。
51.在本技术提供的一具体实施方式中，基于低密度猫品种鉴定snp芯片对所述基因信息进行检测，包括：
52.对所述基因信息进行扩增，获得扩增基因信息；
53.基于低密度猫品种鉴定snp芯片对所述扩增基因信息进行检测。
54.在上述步骤中提取了待鉴定猫的基因信息，此时的基因信息数量较少，为了保证snp芯片上的每个探针都能匹配到基因信息，还需要对基因信息进行扩增，例如，提取的样本液中共有10条基因信息，经过扩增之后，提升了样本液中的基因信息浓度，获得了扩增基因信息，再根据扩增后的样本液进行鉴定，从而可以使用足够多数量的扩增基因信息，使得各探针都能匹配到基因信息，从而避免了因为探针没有捕获到基因信息而导致的鉴定不准确的问题。
55.在本技术提供的另一具体实施方式中，低密度猫品种鉴定snp芯片通过下述步骤
s1042-s1046设计生成：
56.s1042、创建基于猫品种的snp位点库。
57.单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms，snp)主要是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的dna序列多态性，包括碱基的颠换、转换、插入和缺失，是可遗传变异中最常见的一种，占所有已知多态性的90％以上，snp被广泛应用于分子遗传学、物证检验、疾病诊断、治疗等多个领域。
58.snp位点库具体是根据多个品种、多只样本猫的基因信息创建的snp位点库。在snp位点库中记录了众多容易发生突变的点位，在本技术提供的一具体实施方式中，snp位点库中包括有2万到10万个snp位点。
59.更进一步的，创建基于猫品种的snp位点库，包括：
60.确定至少一个猫品种和各猫品种对应的样本猫；
61.采集各样本猫对应的样本基因信息；
62.根据各样本猫对应的样本基因信息创建snp位点库。
63.在实际应用中，可以选取预设数量的猫品种，例如，可以选取目前比较普遍的24个品种的猫，如波斯猫、卷耳猫、伯曼猫、加菲猫、英短猫等等。每只猫选取预设数量的样本猫，例如每个品种的猫选择125只样本猫，基于此，可以获得24个品种，共计3000只样本猫，其中，每个品种对应125只样本猫。
64.在确定了多只样本猫之后，采集各样本猫的样本基因信息，并通过对各样本基因信息进行分析，确定其中snp位点，从而创建snp位点库。
65.s1044、基于基因组关联分析工具集在所述snp位点库中确定多个鉴定snp位点，其中，所述多个鉴定snp位点用于鉴别猫品种。
66.基因组关联分析工具集具体可以理解为plink软件，其旨在以高效率计算的方式执行一系列基本的、大规模的分析，plink软件的重点分析对象是基因型或者表型数据，可以为可视化、注释和结果存储提供一些支持。
67.通过plink软件可以对snp位点库中的snp位点进行分析，从中选对于每个品种的样本猫中未发生突变的多个鉴定snp位点。
68.其中，鉴定snp位点具体是指在某个品种的多个样本猫中，没有发生突变的snp位点。在实际应用中，snp位点是容易发生基因突变的位点，但是如果对于某一个品种的多个样本猫中，其有多个没有发生突变的snp位点，就说明对于这个品种的猫，该snp位点不易发生突变，因此，可以将这些不易发生突变的snp位点作为鉴定snp位点，更进一步的，每个品种的猫对应有该品种的鉴定snp位点。
69.具体的，基于基因组关联分析工具集在所述snp位点库中确定多个鉴定snp位点，包括：
70.根据基因组关联分析工具集在所述snp位点库中确定多个初始待检测snp位点；
71.获取各初始待检测snp位点的位点突变信息；
72.根据各位点突变信息确定各初始待检测snp位点对应的方差膨胀因子值；
73.根据标准方差膨胀因子值和各初始待检测snp位点对应的方差膨胀因子值确定鉴定snp位点。
74.在实际应用中，先通过基因组关联分析工具集选取一个滑动窗口，该滑动窗口用
于确定当前次检测所需的初始待检测snp位点，例如，当该滑动窗口的大小为10时，可以选取10个初始待检测snp位点；当该滑动窗口的大小为30时，可以选取30个初始待检测snp位点；当该滑动窗口大小为50时，可以选取50个初始待检测snp位点。在本技术中不对滑动窗口的大小做限定，以实际应用为准。
75.在本技术提供的一具体实施方式中，以滑动窗口为50个snp为例进行解释说明，在当前次检测中，通过滑动窗口确定50个初始待检测snp位点，获取各初始待检测snp位点对应的位点突变信息，其中，位点突变信息分为0或1，当该snp位点发生突变，则该snp位点对应的位点突变信息为1，若该snp位点未发生突变，则该snp位点对应的位点突变信息为0。
76.在获得各初始待检测snp位点的位点突变信息之后，即可确定各初始待检测nsp位点对应的方差膨胀因子值。方差膨胀因子值(variance inflation factor，vif)是指解释变量之间存在多重共线性时的方差与不存在多重共线性时的方差之比，vif越大，显示共线性越多。
77.在确定了各初始待检测snp位点的方差膨胀因子值之后，即可根据各初始待检测snp位点的方差膨胀因子值与标准方差膨胀因子值进行比对，从初始待检测snp位点中确定鉴定snp位点。
78.更进一步的，根据标准方差膨胀因子值和各初始待检测snp位点对应的方差膨胀因子值确定鉴定snp位点，包括：
79.确定方差膨胀因子值小于等于所述标准方差膨胀因子值的初始待检测snp位点为鉴定snp位点。
80.在本技术提供的一具体实施方式中，选取任一个初始待检测snp位点，并确定该初始待检测snp位点对应的方差膨胀因子值，若该方差膨胀因子值小于或等于标准方差膨胀因子值，则说明该初始待检测snp位点为鉴定snp位点；若该方差膨胀因子值大于标准方差膨胀因子值，则将该初始待检测snp位点删除。
81.至此，当前次检测完成，可以将该滑动窗口继续滑动，执行下一次检测，滑动窗口的滑动步长可以根据实际情况进行设置，例如设置为5个snp位点、10个snp位点、20个snp位点等等，在本技术中，对滑动步长的具体长度不做限定。
82.对snp位点库中的各snp位点执行完上述操作之后，即可得到用于鉴定猫品种的鉴定snp位点。在实际应用中，可以通过上述步骤，获得594个鉴定snp位点(参考基因组)。
83.通过实验验证，当所述标准方差膨胀因子值为1.15的情况下，制作的snp芯片的鉴定准确率较高，因此，在本技术提供的具体实施方式中，将标准方差膨胀因子值设置为1.15。
84.s1046、根据各鉴定snp位点制作低密度猫品种鉴定snp芯片。
85.在通过上述步骤确定了各鉴定snp位点之后，即可根据各鉴定snp位点作为snp芯片的设计基础，从而生成低密度猫品种鉴定snp芯片。
86.具体的，根据各鉴定snp位点制作低密度猫品种鉴定snp芯片，包括：
87.基于各鉴定snp位点确定各鉴定snp位点对应的引物对；
88.根据各引物对制作各鉴定snp位点对应的探针；
89.根据各探针生成低密度猫品种鉴定snp芯片。
90.在实际应用中，可以将各鉴定snp位点确定各鉴定snp位点对应的引物对，参见下
述表1，表1示出了本技术一实施例提供的各鉴定snp位点对应引物对的部分示意数据。
91.表1
[0092][0093][0094]
其中，染色体表示该snp位点在哪条染色体，位置具体是指在该染色体上的具体位置信息，例如a2染色体的148515076，即在a2染色体的第148515076位置。位点参考碱基具体是指参考基因组上的该位点参考碱基类型即野生型的个体的碱基类型，位点变异碱基具体是指突变后的碱基类型即突变个体的碱基类型，上游引物和下游引物具体是指用于定位该snp位点的引物对。
[0095]
在确定了各引物对之后，即可根据各引物对制作各鉴定snp位点的探针，从而进一
步制作低密度猫品种鉴定snp芯片。
[0096]
步骤106：根据所述基因检测结果确定所述待鉴定猫的目标品种信息。
[0097]
通过低密度猫品种鉴定snp芯片对待鉴定猫的基因信息进行检测处理后，获得对应的基因检测结果，并根据检测出来的基因检测结果来进一步确定待鉴定猫的目标品种信息。
[0098]
在实际应用中，不同品种的猫对应的鉴定snp位点的数量也各不相同，对于任一品种的猫，其基因检测结果超过预设阈值的情况下，即可确定该待鉴定猫为对应的品种。
[0099]
本技术实施例提供的猫品种的鉴定方法，包括采集待鉴定猫的基因信息；基于低密度猫品种鉴定snp芯片对所述基因信息进行检测，获得所述基因信息对应的基因检测结果，其中，所述低密度猫品种鉴定snp芯片根据多个猫品种的snp信息设计生成；根据所述基因检测结果确定所述待鉴定猫的目标品种信息。通过本技术提供的猫品种的鉴定方法，实现了在对猫品种进行鉴定的过程中，在采集了猫的基因信息后，使用低密度猫品种鉴定snp芯片即可对该基因信息进行检测，通过低密度猫品种鉴定snp芯片对待鉴定猫进行鉴定，提高了鉴定准确率，用较少密度的snp位点对待鉴定猫进行鉴定，同时还能有效降低检测成本。
[0100]
图2示出了根据本技术一实施例提供的一种低密度猫品种鉴定snp芯片的设计方法的流程图，具体包括以下步骤：
[0101]
步骤202：创建基于猫品种的snp位点库。
[0102]
步骤204：基于基因组关联分析工具集在所述snp位点库中确定多个鉴定snp位点，其中，所述多个鉴定snp位点用于鉴别猫品种。
[0103]
步骤206：根据各鉴定snp位点制作低密度猫品种鉴定snp芯片。
[0104]
在本技术提供的低密度猫品种鉴定snp芯片的设计方法的具体实现方式，与上述实施例中步骤s1042-s1046相同，具体内容，详见上述实施例中步骤s1042-s1046的描述，在此不再赘述。
[0105]
参见图3，图3示出了本技术一实施例提供的验证分类示意图，在本实施方式中，用一种低密度猫品种鉴定snp芯片的设计方法设计的包含有592个snp位点(参考基因组)，猫基因组snp资料中分别选取六个猫的品种，共260只猫的snp数据作为测试样本进行分类snp检测，将分类结果与实际样本比较后，得到图3所示的验证分类示意图，六个品种的猫被清晰的区分开，并无交叠，进一步验证了本技术实施例提供的一种低密度猫品种鉴定snp芯片的设计方法设计出来的snp芯片能准确的鉴定出猫品种。图3的横坐标为pc1，纵坐标为pc2，pca(principal component analysis)是主成分分析，是一种数据降维算法，通过正交变换将一组可能存在相关性的变量转换为一组线性不相关的变量，转换后的这组变量叫主成分，利用pca可以从多个维度分析数据之间的相关性，pc1和pc2是数据降维后形成不同维度的矩阵在空间中的名称。
[0106]
本技术实施例提供的一种低密度猫品种鉴定snp芯片的设计方法，可以制作出低成本、鉴定准确率高的
[0107]
实现了在对猫品种进行鉴定的过程中，在采集了猫的基因信息后，使用低密度猫品种鉴定snp芯片即可对该基因信息进行检测，通过低密度猫品种鉴定snp芯片对待鉴定猫进行鉴定，提高了鉴定准确率，由于对基因信息进行检测是根据位点数量进行收费，用较少
密度的snp位点对待鉴定猫进行鉴定，同时还能有效降低检测成本。
[0108]
与上述猫品种的鉴定方法实施例相对应，本技术还提供了猫品种的鉴定装置实施例，图4示出了本技术一实施例提供的一种猫品种的鉴定装置的结构示意图。如图4所示，该装置包括：
[0109]
采集模块402，被配置为采集待鉴定猫的基因信息；
[0110]
检测模块404，被配置为基于低密度猫品种鉴定snp芯片对所述基因信息进行检测，获得所述基因信息对应的基因检测结果，其中，所述低密度猫品种鉴定snp芯片根据多个猫品种的snp信息设计生成；
[0111]
鉴定模块406，被配置为根据所述基因检测结果确定所述待鉴定猫的目标品种信息。
[0112]
可选的，所述采集模块402，进一步被配置为：
[0113]
采集待鉴定猫的生物检材；
[0114]
在所述生物检材中提取所述待鉴定猫的基因信息。
[0115]
可选的，所述检测模块404，进一步被配置为：
[0116]
对所述基因信息进行扩增，获得扩增基因信息；
[0117]
基于低密度猫品种鉴定snp芯片对所述扩增基因信息进行检测。
[0118]
可选的，所述装置还包括设计模块，被配置为：
[0119]
创建基于猫品种的snp位点库；
[0120]
基于基因组关联分析工具集在所述snp位点库中确定多个鉴定snp位点；
[0121]
根据各鉴定snp位点制作低密度猫品种鉴定snp芯片。
[0122]
可选的，所述设计模块，进一步被配置为：
[0123]
确定至少一个猫品种和各猫品种对应的样本猫；
[0124]
采集各样本猫对应的样本基因信息；
[0125]
根据各样本猫对应的样本基因信息创建snp位点库。
[0126]
可选的，所述设计模块，进一步被配置为：
[0127]
根据基因组关联分析工具集在所述snp位点库中确定多个初始待检测snp位点；
[0128]
获取各初始待检测snp位点的位点突变信息；
[0129]
根据各位点突变信息确定各初始待检测snp位点对应的方差膨胀因子值；
[0130]
根据标准方差膨胀因子值和各初始待检测snp位点对应的方差膨胀因子值确定鉴定snp位点。
[0131]
可选的，所述设计模块，进一步被配置为：
[0132]
确定方差膨胀因子值小于等于所述标准方差膨胀因子值的初始待检测snp位点为鉴定snp位点。
[0133]
可选的，所述设计模块，进一步被配置为：
[0134]
基于各鉴定snp位点确定各鉴定snp位点对应的引物对；
[0135]
根据各引物对制作各鉴定snp位点对应的探针；
[0136]
根据各探针生成低密度猫品种鉴定snp芯片。
[0137]
本技术实施例提供的猫品种的鉴定装置，包括采集待鉴定猫的基因信息；基于低密度猫品种鉴定snp芯片对所述基因信息进行检测，获得所述基因信息对应的基因检测结
果，其中，所述低密度猫品种鉴定snp芯片根据多个猫品种的snp信息设计生成；根据所述基因检测结果确定所述待鉴定猫的目标品种信息。通过本技术提供的猫品种的鉴定装置，实现了在对猫品种进行鉴定的过程中，在采集了猫的基因信息后，使用低密度猫品种鉴定snp芯片即可对该基因信息进行检测，通过低密度猫品种鉴定snp芯片对待鉴定猫进行鉴定，提高了鉴定准确率，用较少密度的snp位点对待鉴定猫进行鉴定，同时还能有效降低检测成本。
[0138]
上述为本实施例的一种猫品种的鉴定装置的示意性方案。需要说明的是，该猫品种的鉴定装置的技术方案与上述的猫品种的鉴定方法的技术方案属于同一构思，猫品种的鉴定装置的技术方案未详细描述的细节内容，均可以参见上述猫品种的鉴定方法的技术方案的描述。
[0139]
图5示出了根据本技术一实施例提供的一种计算设备500的结构框图。该计算设备500的部件包括但不限于存储器510和处理器520。处理器520与存储器510通过总线530相连接，数据库550用于保存数据。
[0140]
计算设备500还包括接入设备540，接入设备540使得计算设备500能够经由一个或多个网络560通信。这些网络的示例包括公用交换电话网(pstn，public switched telephone network)、局域网(lan，local area network)、广域网(wan，wide area network)、个域网(pan，personal area network)或诸如因特网的通信网络的组合。接入设备540可以包括有线或无线的任何类型的网络接口(例如，网络接口卡(nic，network interface controller))中的一个或多个，诸如ieee802.11无线局域网(wlan，wireless local area network)无线接口、全球微波互联接入(wi-max，worldwide interoperability for microwave access)接口、以太网接口、通用串行总线(usb，universal serial bus)接口、蜂窝网络接口、蓝牙接口、近场通信(nfc，near field communication)接口，等等。
[0141]
在本技术的一个实施例中，计算设备500的上述部件以及图5中未示出的其他部件也可以彼此相连接，例如通过总线。应当理解，图5所示的计算设备结构框图仅仅是出于示例的目的，而不是对本技术范围的限制。本领域技术人员可以根据需要，增添或替换其他部件。
[0142]
计算设备500可以是任何类型的静止或移动计算设备，包括移动计算机或移动计算设备(例如，平板计算机、个人数字助理、膝上型计算机、笔记本计算机、上网本等)、移动电话(例如，智能手机)、可佩戴的计算设备(例如，智能手表、智能眼镜等)或其他类型的移动设备，或者诸如台式计算机或个人计算机(pc，personal computer)的静止计算设备。计算设备500还可以是移动式或静止式的服务器。
[0143]
其中，处理器520执行所述计算机指令时实现所述的猫品种的鉴定方法或低密度猫品种鉴定snp芯片的设计方法的步骤。
[0144]
上述为本实施例的一种计算设备的示意性方案。需要说明的是，该计算设备的技术方案与上述的猫品种的鉴定方法或低密度猫品种鉴定snp芯片的设计方法的技术方案属于同一构思，计算设备的技术方案未详细描述的细节内容，均可以参见上述猫品种的鉴定方法或低密度猫品种鉴定snp芯片的设计方法的技术方案的描述。
[0145]
本技术一实施例还提供一种计算机可读存储介质，其存储有计算机指令，该计算
机指令被处理器执行时实现如前所述猫品种的鉴定方法或低密度猫品种鉴定snp芯片的设计方法的步骤。
[0146]
上述为本实施例的一种计算机可读存储介质的示意性方案。需要说明的是，该存储介质的技术方案与上述的猫品种的鉴定方法或低密度猫品种鉴定snp芯片的设计方法的技术方案属于同一构思，存储介质的技术方案未详细描述的细节内容，均可以参见上述猫品种的鉴定方法或低密度猫品种鉴定snp芯片的设计方法的技术方案的描述。
[0147]
上述对本技术特定实施例进行了描述。其它实施例在所附权利要求书的范围内。在一些情况下，在权利要求书中记载的动作或步骤可以按照不同于实施例中的顺序来执行并且仍然可以实现期望的结果。另外，在附图中描绘的过程不一定要求示出的特定顺序或者连续顺序才能实现期望的结果。在某些实施方式中，多任务处理和并行处理也是可以的或者可能是有利的。
[0148]
所述计算机指令包括计算机程序代码，所述计算机程序代码可以为源代码形式、对象代码形式、可执行文件或某些中间形式等。所述计算机可读介质可以包括：能够携带所述计算机程序代码的任何实体或装置、记录介质、u盘、移动硬盘、磁碟、光盘、计算机存储器、只读存储器(rom，read-only memory)、随机存取存储器(ram，random access memory)、电载波信号、电信信号以及软件分发介质等。需要说明的是，所述计算机可读介质包含的内容可以根据专利实践的要求进行适当的增减，例如在某些地域，根据专利实践，计算机可读介质不包括电载波信号和电信信号。
[0149]
需要说明的是，对于前述的各方法实施例，为了简便描述，故将其都表述为一系列的动作组合，但是本领域技术人员应该知悉，本技术并不受所描述的动作顺序的限制，因为依据本技术，某些步骤可以采用其它顺序或者同时进行。其次，本领域技术人员也应该知悉，说明书中所描述的实施例均属于优选实施例，所涉及的动作和模块并不一定都是本技术所必须的。
[0150]
在上述实施例中，对各个实施例的描述都各有侧重，某个实施例中没有详述的部分，可以参见其它实施例的相关描述。
[0151]
以上公开的本技术优选实施例只是用于帮助阐述本技术。可选实施例并没有详尽叙述所有的细节，也不限制该发明仅为所述的具体实施方式。显然，根据本技术的内容，可作很多的修改和变化。本技术选取并具体描述这些实施例，是为了更好地解释本技术的原理和实际应用，从而使所属技术领域技术人员能很好地理解和利用本技术。本技术仅受权利要求书及其全部范围和等效物的限制。

技术特征：
1.一种猫品种的鉴定方法，其特征在于，包括：采集待鉴定猫的基因信息；基于低密度猫品种鉴定snp芯片对所述基因信息进行检测，获得所述基因信息对应的基因检测结果，其中，所述低密度猫品种鉴定snp芯片根据多个猫品种的snp信息设计生成；根据所述基因检测结果确定所述待鉴定猫的目标品种信息。2.如权利要求1所述的方法，其特征在于，采集待鉴定猫的基因信息，包括：采集待鉴定猫的生物检材；在所述生物检材中提取所述待鉴定猫的基因信息。3.如权利要求1所述的方法，其特征在于，基于低密度猫品种鉴定snp芯片对所述基因信息进行检测，包括：对所述基因信息进行扩增，获得扩增基因信息；基于低密度猫品种鉴定snp芯片对所述扩增基因信息进行检测。4.如权利要求1所述的方法，其特征在于，低密度猫品种鉴定snp芯片通过下述步骤设计生成：创建基于猫品种的snp位点库；基于基因组关联分析工具集在所述snp位点库中确定多个鉴定snp位点，其中，所述多个鉴定snp位点用于鉴别猫品种；根据各鉴定snp位点制作低密度猫品种鉴定snp芯片。5.如权利要求4所述的方法，其特征在于，创建基于猫品种的snp位点库，包括：确定至少一个猫品种和各猫品种对应的样本猫；采集各样本猫对应的样本基因信息；根据各样本猫对应的样本基因信息创建snp位点库。6.如权利要求4所述的方法，其特征在于，基于基因组关联分析工具集在所述snp位点库中确定多个鉴定snp位点，包括：根据基因组关联分析工具集在所述snp位点库中确定多个初始待检测snp位点；获取各初始待检测snp位点的位点突变信息；根据各位点突变信息确定各初始待检测snp位点对应的方差膨胀因子值；根据标准方差膨胀因子值和各初始待检测snp位点对应的方差膨胀因子值确定鉴定snp位点。7.如权利要求6所述的方法，其特征在于，根据标准方差膨胀因子值和各初始待检测snp位点对应的方差膨胀因子值确定鉴定snp位点，包括：确定方差膨胀因子值小于等于所述标准方差膨胀因子值的初始待检测snp位点为鉴定snp位点。8.如权利要求6所述的方法，其特征在于，所述标准方差膨胀因子值为1.15。9.如权利要求4所述的方法，其特征在于，根据各鉴定snp位点制作低密度猫品种鉴定snp芯片，包括：基于各鉴定snp位点确定各鉴定snp位点对应的引物对；根据各引物对制作各鉴定snp位点对应的探针；根据各探针生成低密度猫品种鉴定snp芯片。
10.一种低密度猫品种鉴定snp芯片的设计方法，其特征在于，包括：创建基于猫品种的snp位点库；基于基因组关联分析工具集在所述snp位点库中确定多个鉴定snp位点，其中，所述多个鉴定snp位点用于鉴别猫品种；根据各鉴定snp位点制作低密度猫品种鉴定snp芯片。11.一种猫品种的鉴定装置，其特征在于，包括：采集模块，被配置为采集待鉴定猫的基因信息；检测模块，被配置为基于低密度猫品种鉴定snp芯片对所述基因信息进行检测，获得所述基因信息对应的基因检测结果，其中，所述低密度猫品种鉴定snp芯片根据多个猫品种的snp信息设计生成；鉴定模块，被配置为根据所述基因检测结果确定所述待鉴定猫的目标品种信息。12.一种计算设备，包括存储器、处理器及存储在存储器上并可在处理器上运行的计算机指令，其特征在于，所述处理器执行所述计算机指令时实现权利要求1-9或者10任意一项所述方法的步骤。13.一种计算机可读存储介质，其存储有计算机指令，其特征在于，该计算机指令被处理器执行时实现权利要求1-9或者10任意一项所述方法的步骤。

技术总结
本申请提供猫品种的鉴定方法及装置，其中所述猫品种的鉴定方法包括：采集待鉴定猫的基因信息；基于低密度猫品种鉴定SNP芯片对所述基因信息进行检测，获得所述基因信息对应的基因检测结果，其中，所述低密度猫品种鉴定SNP芯片根据多个猫品种的SNP信息设计生成；根据所述基因检测结果确定所述待鉴定猫的目标品种信息。通过低密度猫品种鉴定SNP芯片对待鉴定猫进行鉴定，提高了鉴定准确率，用较少密度的SNP位点对待鉴定猫进行鉴定，同时还能有效降低检测成本。低检测成本。低检测成本。


技术研发人员：管思聪 李桂梅 王识之 马玉洁
受保护的技术使用者：中国科学院昆明动物研究所
技术研发日：2023.05.25
技术公布日：2023/8/21