一种吡唑环三核银(I)配合物在有机分子结构测定中的应用

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一种吡唑环三核银(i)配合物在有机分子结构测定中的应用
技术领域
1.本发明涉及一种吡唑环三核银(i)配合物在有机分子结构测定中的应用,属于有机分子结构鉴定技术领域。


背景技术:

2.结构鉴定在化学和药学领域中有着重要的地位。单晶x射线衍射(scxrd)可在原子水平上提供晶体化合物明确的三维结构,被认为是最可靠的结构鉴定方法。然而,长期以来使用scxrd进行结构鉴定的一个固有局限性是:大小适合、衍射良好的单晶体通常难以获得。众多化合物,如低熔点、无定型粉末、非晶态固体化合物以及微量丰度天然产物等,由于其结晶困难,往往难以通过scxrd技术表征其结构。
3.为解决有机分子结构鉴定这一难题,makoto fujita团队首次报道了利用“晶体海绵”鉴定化合物结构的方法(nature,2013,495,461

466)。该方法利用金属

有机框架具有的高度规则孔道,可在溶液中吸收目标有机分子,被吸附的有机分子通过主

客体相互作用在金属

有机框架的孔道中有序排列,进而通过scxrd分析可确定目标有机分子的结构。随后,一系列具有类似晶体海绵性质的金属

有机框架、多孔有机材料或超分子笼先后被报道(acs cent.sci.,2021,7,406

414;angew.chem.int.ed.,2021 60,25204

25222)。然而,大多数晶体海绵的空腔/孔道大小有限,这阻碍了复杂有机分子的进入。此外,晶体海绵在许多溶剂中的稳定性较差,使其难以识别更多类型的有机分子。同时,在吸收目标有机分子过程中繁琐的溶剂交换、目标有机分子的低占有率以及晶体的严重无序进一步限制了其应用。
4.利用结晶伴侣与目标分子通过非共价相互作用形成共晶,是另一种解决难结晶化合物结构鉴定的策略。采用该种方法对难结晶的有机分子进行结构鉴定,需要一种能与不同性状、大小和复杂性的有机分子形成共晶的广谱性结晶伴侣,然而该种广谱性结晶伴侣尚未被公开。


技术实现要素:

5.本发明提供一种吡唑环三核银(i)配合物在有机分子结构测定中的应用,适用于难结晶化合物、非晶态化合物或混合物样品的分子结构测定。
6.为达到上述目的,本发明所采用的技术方案是:一种吡唑环三核银(i)配合物在有机分子结构测定中的应用,所述吡唑环三核银(i)配合物为3,5-双三氟甲基吡唑环三核银(i)配合物。
7.一种有机分子结构测定的方法,包括以下步骤:将吡唑环三核银(i)配合物与待测样品混合,得到吡唑环三核银(i)配合物和待测样品中有机分子的共晶,并对所述共晶进行单晶衍射分析,获得所述共晶的晶体衍射数据;根据共晶的晶体衍射数据,解析晶体结构,从而获得待测有机分子的化学结构和立体构型。
8.进一步地,所述吡唑环三核银(i)配合物为3,5-双三氟甲基吡唑环三核银(i)配合
物,采用3,5-双三氟甲基吡唑和氧化银合成。
9.进一步地,所述根据共晶的晶体衍射数据,解析晶体结构,具体包括以下步骤:采用直接法确定部分非氢原子的位置,然后使用差值函数法和最小二乘法得到所有非氢原子的坐标;得到所有非氢原子的坐标后,进一步指认原子种类和结构精修,并用理论加氢的方法得到所有氢原子的坐标。
10.进一步地,将吡唑环三核银(i)配合物与待测样品在有机溶剂中混合后,在避光条件下,对吡唑环三核银(i)配合物与待测有机分子的共晶进行培养;所述共晶培养的温度为-25℃~150℃。
11.进一步地,所述吡唑环三核银(i)配合物和待测样品混合的摩尔比为1:10~10:1。
12.进一步地,所述有机溶剂为甲醇、乙醇、乙腈、二氯甲烷、三氯甲烷、环己烷、石油醚、丙酮、乙醚、苯、乙酸乙酯、甲苯、异丙醇、1,4-二氧六环中的一种或多种。
13.进一步地,所述单晶衍射分析的温度为-173℃~室温。
14.进一步地,采用溶剂挥发法、溶剂扩散法、气相扩散法、溶剂热法中的一种获得共晶。
15.本发明可温在和条件(室温)下,对非晶态化合物以及多手性复杂化合物的结构进行测定。
16.本发明由于采用了吡唑环三核银(i)配合物作为有机分子的结晶伴侣,通过获取吡唑环三核银(i)配合物与有机分子共晶的方式来解析有机分子的结构,从而省略了对混合物进行色谱分离和波谱鉴定的步骤,使得有机分子的鉴定更加便捷和高效。同时,采用吡唑环三核银(i)配合物将有机分子共晶,无需采用高温熔融或溶剂热等方法来培养晶体,进一步简化了有机分子的结构鉴定。
17.对于某些只含有chon等轻元素的待测有机分子,难以确定其绝对构型,但是采用吡唑环三核银(i)配合物对待测有机分子进行共晶后,可由整个晶体的手性来确定其绝对构型。
附图说明
18.图1为本发明中ag3pz3的晶体结构图;
19.图2为本发明实施例1中ag3pz3·
trans-anethol的晶体结构图;
20.图3为本发明实施例2中ag3pz3·
chrysophanol的晶体结构图;
21.图4为本发明实施例3中ag3pz3·
7-hydroxy-5-methoxy-6,8-dimethylflavanone的晶体结构图;
22.图5为本发明实施例4中ag3pz3·
ammothamnine的晶体结构图;
23.图6为本发明实施例5中ag3pz3·
santonin的晶体结构图;
24.图7为本发明实施例6中ag3pz3·
spironolactone的晶体结构图;
25.图8为本发明实施例7中ag3pz3·
1的晶体结构图;
26.图9为本发明实施例7中ag3pz3·
2的晶体结构图;
27.图10为本发明实施例7中ag3pz33的晶体结构图;
28.图11为本发明实施例7中ag3pz3·4·
5的晶体结构图。
具体实施方式
29.为了更好的理解本发明的实质,下面结合具体实施例和附图对本发明作进一步的阐述。
30.环三核配合物是一类由三个单价铸币金属阳离子和三个杂环桥联配体组成的平面型配位化合物(chem.rev.,2020,120,9675

9742;chem.commun.,2019,55,7134

7146),由于其独特的超分子作用(如亲金属作用和π-酸
···
碱作用),该类配合物容易与自身或其它分子形成晶态聚集体,其结构可被单晶x射线衍射解析。通过改变金属离子、有机配体和配体上的取代基,可大范围调控环三核配合物的π-酸/碱性和亲金属性,进一步改变其性能。目前该类配合物在光电材料、吸附与分离、催化等领域展示出良好的应用前景。
31.而本发明以吡唑环三核银(i)配合物作为待测有机分子的结晶伴侣,利用其π-酸
···
碱超分子作用应用于待测有机分子的结构鉴定;
32.所述吡唑环三核银(i)配合物具体为3位和/或5位取代的吡唑环三核银(i)配合物,分别为3-三氟甲基吡唑环三核银(i)配合物、3-三氟甲基-5-甲基吡唑环三核银(i)配合物、3-三氟甲基-5-叔丁基吡唑环三核银(i)配合物、3-三氟甲基-5-苯基吡唑环三核银(i)配合物、3,5-双三氟甲基吡唑环三核银(i)配合物以及3,5-双硝基吡唑环三核银(i)配合物。其中,优选的吡唑环三核银(i)配合物为3,5-双三氟甲基吡唑环三核银(i)配合物,化学式为ag3[3,5-(cf3)2pz]3,命名为ag3pz3,它是一个高度氟化、强π-酸性、具有平面型稳定三金属配位九元环的金属

有机配合物,上述化学结构如式依次为:
[0033][0034]
所述的ag3pz3具有良好的稳定性、溶解性和结晶性。
[0035]
ag3pz3与不同的待测有机分子可通过多种非共价相互作用(如π-酸
···
碱相互作用、c-h
···
f相互作用等)形成晶态聚集体,通过这一策略可促使难结晶待测有机分子形成共晶。共晶的晶体结构同时包含吡唑环三核银(i)配合物和待测有机分子,因此可采用
吡唑环三核银(i)配合物作为待测有机分子的结晶伴侣,然后通过单晶衍射的方式测定有机分子的化学结构和立体构型。
[0036]
本发提供了一种有机分子结构测定的方法,适用于非晶态化合物、多手性复杂化合物以及混合物样品的分子结构测定,以ag3pz3为例具体包括以下步骤:
[0037]
步骤一,制备ag3pz3并对ag3pz3晶体进行单晶x射线衍射分析。
[0038]
在本发明的部分优选实施例中,采用3,5-双三氟甲基吡唑和氧化银合成ag3pz3,具体为:
[0039]
将摩尔比为1:5~5:1的氧化银(ag2o)和3,5-双三氟甲基吡唑([3,5-(cf3)2pz]h)混合溶解在10~50ml的乙醚溶液中。将混合溶液置于避光条件下热回流并冷却后,通过硅胶柱除去不溶物。利用真空泵减压回收溶剂,得到白色粉末。将所述白色粉末再次溶解并在室温下通过溶剂挥发得到无色的晶体,收集所述晶体并洗涤,随后在100℃下干燥至恒重,得到高纯度的ag3pz3。
[0040]
步骤二,将步骤一中制备得到的ag3pz3和待测有机分子样品混合,得到ag3pz3和待测有机分子的共晶。收集所述共晶并进行单晶衍射分析。
[0041]
所述的待测样品选自有机分子单体、有机分子的混合物或天然提取物中的一种。所述的有机分子单体选自醇类、醛类、酮类、醚类、酯类、胺类、氮氧化物、硫化物中的一种。待测样品包括天然来源的挥发油类、苯丙素类、黄酮类、蒽醌类、萜类、生物碱类、甾体类化合物等。
[0042]
在本发明的部分实施例中,将摩尔比为1:10~10:1的结晶伴侣ag3pz3和待测样品溶解在有机溶剂中并摇匀过滤,得到澄清的混合溶液;并在避光条件下,对ag3pz3和待测有机分子的共晶进行培养。作为本发明的优选实施例,所述结晶伴侣ag3pz3和待测样品的摩尔比为1:2、2:1或5:1,更优选为等摩尔混合。
[0043]
作为本发明的优选实施例,所述有机溶剂选自甲醇、乙醇、乙腈、二氯甲烷、三氯甲烷、环己烷、石油醚、丙酮、乙醚、苯、乙酸乙酯、甲苯、异丙醇、1,4-二氧六环中的一种或多种。
[0044]
在本发明的部分实施例中,为获得共晶,可采用溶剂挥发法、溶剂扩散法、气相扩散法、溶剂热法中的一种。
[0045]
作为本发明的优选实施例,所述ag3pz3和待测有机分子的共晶培养温度为-25℃~150℃。
[0046]
步骤三,根据共晶的衍射数据解析晶体结构,从而获得待测有机分子的化学结构和立体构型。
[0047]
在本发明的部分实施例中,采用rigaku单晶衍射仪对步骤一中的ag3pz3和步骤二中的共晶进行单晶衍射分析,并收集两者的衍射数据。其中,光源为cu kα靶在处的辐射,单晶衍射数据收集的温度为-173℃~室温。
[0048]
收集的衍射数据用shelxtl 6.10程序包和olex2 1.2软件进行解析,采用直接法(direct-methods)确定部分非氢原子的位置,然后使用差值函数法(difference fourier map)和最小二乘法(full-matrix least-square method)得到所有非氢原子的坐标。
[0049]
得到所有非氢原子的坐标后,进一步指认原子种类和结构精修,并用理论加氢的方法得到所有氢原子的坐标。
[0050]
实施例1
[0051]
采用前述环三核银(i)配合物ag3pz3作为结晶伴侣,测定茴香脑(trans-anethol)的分子结构。
[0052]
茴香脑为一个具有苯丙素结构的天然挥发油类,常温下为液体(熔点:20

21℃),化学结构如式ⅶ所示:
[0053][0054]
s1.制备ag3pz3并对ag3pz3晶体进行单晶x射线衍射分析。
[0055]
s1.1.将43.2mg的氧化银(ag2o)和20.4mg的3,5-双三氟甲基吡唑([3,5-(cf3)2pz]h)混合溶解在20~30ml的乙醚溶液中。将混合溶液置于避光条件下热回流6h,冷却后,通过硅胶柱除去不溶物,利用真空泵减压回收溶剂,得到白色粉末85.1mg(产率:91.2%)。将白色粉末溶解在环己烷中,在室温下通过溶剂挥发得到无色晶体,收集晶体并洗涤,随后在100℃下干燥至恒重,得到高纯度的ag3pz3。
[0056]
s1.2.挑选s1.1中晶面良好、大小适宜的ag3pz3晶体进行单晶x射线衍射分析,制得的晶体属于单斜晶系,空间群为c2/c,晶胞参数为:a=90
°
,β=97.1576(6)
°
,γ=90
°
,解析所得的ag3pz3晶体结构见图1。
[0057]
s2.将s1.2中制备得到的ag3pz3和待测有机分子样品混合,得到ag3pz3和待测有机分子的共晶。收集所述共晶并进行单晶衍射。
[0058]
s2.1.称取0.5mg的茴香脑溶解在1ml的二氯甲烷中,随后加入4倍摩尔量s1.2中所得的高纯度ag3pz3。将混合溶液过滤,随后转移到一个带帽的玻璃小瓶(体积:1.5ml)。在玻璃小瓶顶部插入一根针管以控制溶剂的挥发速率。将玻璃小瓶置于避光条件下于室温进行缓慢的溶剂挥发,待溶剂挥发完全时(约2

3天),瓶底出现无色片状晶体。
[0059]
s2.2.挑选步骤s2.1中晶面良好、大小适合,且晶胞参数不同于ag3pz3的晶体进行单晶x射线衍射分析,得到共晶ag3pz3·
trans-anethol。收集共晶的完整衍射数据。所制得的晶体属于正交晶系,空间群为pca21,晶胞参数为:,晶胞参数为:α=90
°
,β=90
°
,γ=90
°
,,
[0060]
s1.2.与s2.2单晶衍射所用的仪器均为rigaku单晶衍射仪,光源为cu kα靶在处的辐射,单晶数据收集温度为100k。
[0061]
s3.根据ag3pz3和共晶两者的衍射数据,解析两者的晶体结构,从而获得待测有机分子的化学结构。
[0062]
将s1.2与s2.2中收集的衍射数据用shelxtl 6.10程序包和olex2 1.2软件进行解析,采用直接法(direct-methods)确定部分非氢原子的位置,然后使用差值函数法(difference fourier map)和最小二乘法(full-matrix least-square method)得到所有非氢原子的坐标。进一步指认原子种类和结构精修,并用理论加氢的方法得到所有氢原子
的坐标。由此解析出液体分子茴香脑的晶体结构。
[0063]
ag3pz3·
trans-anethol晶体结构见图2,晶体学衍射数据和结构精修的部分参数见表1。
[0064]
表1.ag3pz3·
trans-anethol的晶体学数据
[0065][0066][0067]
实施例2
[0068]
采用前述环三核银(i)配合物ag3pz3作为结晶伴侣,测定大黄酚(chrysophanol)的分子结构。
[0069]
大黄酚为一个蒽醌类化合物,结构中包含羰基、羟基、苯等官能团,化学结构如式

所示:
[0070][0071][0072]
s1.制备ag3pz3并对ag3pz3晶体进行单晶x射线衍射分析。
[0073]
采用与实施例1中相同的方法制备高纯度ag3pz3。
[0074]
s2.将s1.2中制备得到的ag3pz3和待测有机分子样品混合,得到ag3pz3和待测有机分子的共晶。收集所述共晶并进行单晶衍射。
[0075]
s2.1.称取0.6mg的大黄酚溶解在1ml的二氯甲烷-乙醇混合溶液(体积比1:3)中,随后加入2倍摩尔量s1中所得的高纯度ag3pz3。将混合溶液过滤,随后转移到一个带帽的玻璃小瓶(体积:1.5ml)。在玻璃小瓶顶部插入一根针管以控制溶剂挥发速率。将玻璃小瓶置于避光条件下于室温进行缓慢的溶剂挥发,待溶剂挥发完全时(约2

3天),瓶底出现黄色片状晶体。
[0076]
s2.2.挑选s2.1中晶面良好、大小适合,且晶胞参数不同于ag3pz3的晶体进行单晶x射线衍射分析,得到共晶ag3pz3·
chrysophanol。制得的晶体属于正交晶系,空间群为pbca,晶胞参数为:晶胞参数为:α=90
°
,β=90
°
,γ=90
°
,,
[0077]
采用与实施例1中s3相同的方法解析大黄酚的晶体结构。
[0078]
ag3pz3·
chrysophanol晶体结构见图3,晶体学衍射数据和结构精修的部分参数见表2。
[0079]
表2.ag3pz3chrysophanol的晶体学数据
[0080]
[0081][0082]
实施例3
[0083]
采用前述环三核银(i)配合物ag3pz3作为结晶伴侣,测定7-hydroxy-5-methoxy-6,8-dimethylflavanone的分子结构。
[0084]
7-hydroxy-5-methoxy-6,8-dimethylflavanone为一个二氢黄酮类化合物,结构中包含羰基、羟基、醚键、苯等官能团,化学结构如式

所示:
[0085][0086]
s1.制备ag3pz3并对ag3pz3晶体进行单晶x射线衍射分析。
[0087]
采用与实施例1中相同的方法制备高纯度ag3pz3。
[0088]
s2.将s1.2中制备得到的ag3pz3和待测有机分子样品混合,得到ag3pz3和待测有机
分子的共晶。收集所述共晶并进行单晶衍射。
[0089]
s2.1.称取0.7mg的7-hydroxy-5-methoxy-6,8-dimethylflavanone溶解在1ml的二氯甲烷-丙酮混合溶液(体积比4:1)中,随后加入等摩尔量s1中所得的高纯度ag3pz3。将混合溶液过滤,随后转移到一个带帽的玻璃小瓶(体积:1.5ml)。在玻璃小瓶顶部插入一根针管以控制溶剂挥发速率。将玻璃小瓶置于避光条件下于室温进行缓慢的溶剂挥发,待溶剂挥发完全时(约2

3天),瓶底出现淡黄色块状晶体。
[0090]
s2.2.挑选s2.1中晶面良好、大小适合,且晶胞参数不同于ag3pz3的晶体进行单晶x射线衍射分析,得到共晶ag3pz
3-7-hydroxy-5-methoxy-6,8-dimethylflavanone。制得的晶体属于三斜晶系,空间群为晶胞参数为:晶胞参数为:α=107.384(3)
°
,β=102.336(2)
°
,γ=90.912(2)
°
,,
[0091]
采用与实施例1中s3相同的方法解析7-hydroxy-5-methoxy-6,8-dimethylflavanone的晶体结构。
[0092]
ag3pz
3-7-hydroxy-5-methoxy-6,8-dimethylflavanone晶体结构见图4,晶体学衍射数据和结构精修的部分参数见表3。
[0093]
表3.ag3pz37-hydroxy-5-methoxy-6,8-dimethylflavanone的晶体学数据
[0094][0095]
实施例4
[0096]
采用前述环三核银(i)配合物ag3pz3作为结晶伴侣,测定氧化苦参碱(ammothamnine)的分子结构。
[0097]
氧化苦参碱为一个具有四环结构的生物碱类化合物,结构中包含羰基、氮氧基等官能团,具有4个手性中心,化学结构如式

所示:
[0098][0099]
s1.制备ag3pz3并对ag3pz3晶体进行单晶x射线衍射分析。
[0100]
采用与实施例1中相同的方法制备高纯度ag3pz3。
[0101]
s2.将s1.2中制备得到的ag3pz3和待测有机分子样品混合,得到ag3pz3和待测有机分子的共晶。收集所述共晶并进行单晶衍射。
[0102]
s2.1.称取0.5mg的氧化苦参碱样品溶解在1ml的三氯甲烷-乙腈混合溶液(体积比1:2)中,随后加入等摩尔量s1中所得的高纯度ag3pz3。将混合溶液过滤,随后转移到一个带帽的玻璃小瓶(体积:1.5ml)。在玻璃小瓶顶部插入一根针管以控制溶剂挥发速率。将玻璃小瓶置于避光条件下于室温进行缓慢的溶剂挥发,待溶剂挥发完全时(约2

3天),瓶底出现无色块状晶体。
[0103]
s2.2.挑选s2.1中晶面良好、大小适合,且晶胞参数不同于ag3pz3的晶体进行单晶x射线衍射分析,得到共晶ag3pz3·
ammothamnine。制得的晶体属于单斜晶系,空间群为p21,晶胞参数为:晶胞参数为:a=90
°
,β=112.500(2)
°
,γ=90
°
,
[0104]
采用与实施例1中s3相同的方法解析氧化苦参碱的晶体结构。基于晶体的flack参数[-0.013(6)],可确定氧化苦参碱的绝对构型。
[0105]
ag3pz3·
ammothamnine晶体结构见图5,晶体学衍射数据收集和结构精修的部分参数见表4。
[0106]
表4.ag3pz3·
ammothamnine的晶体学数据
[0107][0108]
实施例5
[0109]
采用前述环三核银(i)配合物ag3pz3作为结晶伴侣,测定山道年(santonin)的分子结构。
[0110]
山道年为一个具有6/6/5三环结构的天然萜类驱虫剂,结构中包含双键、α,β不饱和酮以及酯基官能团,具有4个手性中心,化学结构如式

所示:
[0111][0112]
s1.制备ag3pz3并对ag3pz3晶体进行单晶x射线衍射分析。
[0113]
采用与实施例1中相同的方法制备高纯度ag3pz3。
[0114]
s2.将s1.2中制备得到的ag3pz3和待测有机分子样品混合,得到ag3pz3和待测有机分子的共晶。收集所述共晶并进行单晶衍射。
[0115]
s2.1.称取0.6mg的山道年溶解在1.5ml的环己烷-二氯甲烷溶液(体积比1:2)中,随后加入等摩尔量(a)中所得的高纯度ag3pz3。将混合溶液过滤,随后转移到一个带帽的玻璃小瓶(体积:1.5ml)。在玻璃小瓶顶部插入一根针管以控制溶剂挥发速率。将玻璃小瓶置于避光条件下于室温进行缓慢的溶剂挥发,待溶剂挥发完全时(约2

3天),瓶底出现无色块状晶体。
[0116]
s2.2.挑选s2.1中晶面良好、大小适合,且晶胞参数不同于ag3pz3的晶体进行单晶x射线衍射分析,得到共晶ag3pz3santonin。制得的晶体属于正交晶系,空间群为p212121,晶胞参数为:参数为:a=90
°
,β=90
°
,γ=90
°
,,
[0117]
采用与实施例1中s3相同的方法解析山道年的晶体结构。基于晶体的flack参数[-0.026(5)],可确定山道年分子的绝对构型。ag3pz3santonin晶体结构见图6,晶体学衍射数据和结构精修的部分参数见表5。
[0118]
表5.ag3pz3santonin的晶体学数据
[0119][0120]
实施例6
[0121]
采用前述环三核银(i)配合物ag3pz3作为结晶伴侣,测定螺内酯(spironolactone)的分子结构。
[0122]
螺内酯是一个天然利尿药,具有6/6/6/5/5五环甾体母核,结构中包含羰基、内酯和硫酯官能团,具有7个连续手性中心,化学结构如式

所示:
[0123][0124]
s1.制备ag3pz3并对ag3pz3晶体进行单晶x射线衍射分析。
[0125]
采用与实施例1中相同的方法制备高纯度ag3pz3。
[0126]
s2.将s1.2中制备得到的ag3pz3和待测有机分子样品混合,得到ag3pz3和待测有机分子的共晶。收集所述共晶并进行单晶衍射。
[0127]
s2.1.称取1.0mg的螺内酯溶解在1.5ml的环己烷-二氯甲烷混合溶液(体积比1:1)中,随后加入等摩尔量(a)中所得的高纯度ag3pz3。将混合溶液过滤,随后转移到一个带帽的玻璃小瓶(体积:1.5ml)。在玻璃小瓶顶部插入一根针管以控制溶剂挥发速率。将玻璃小瓶置于避光条件下于室温进行缓慢的溶剂挥发,待溶剂挥发完全时(约2

3天),瓶底出现无色针状晶体。
[0128]
s2.2.挑选s2.1中晶面良好、大小适合,且晶胞参数不同于ag3pz3的晶体进行单晶x射线衍射分析,得到共晶ag3pz3spironolactone。制得的晶体属于单斜晶系,空间群为p21,晶胞参数为:晶胞参数为:a=90
°
,β=99.7340(10)
°
,γ=90
°
,
[0129]
采用与实施例1中s3相同的方法解析螺内酯的晶体结构。基于晶体的flack参数[-0.024(13)],可确定螺内酯分子的绝对构型。
[0130]
ag3pz3spironolactone晶体结构见图7,其晶体学衍射数据和结构精修的部分参数见表6。
[0131]
表6.ag3pz3spironolactone的晶体学数据
[0132][0133][0134]
实施例7
[0135]
采用前述环三核银(i)配合物ag3pz3作为结晶伴侣,直接从药用植物水翁花的提取物中鉴定化合物结构。
[0136]
s1.制备ag3pz3并对ag3pz3晶体进行单晶x射线衍射分析。
[0137]
采用与实施例1中相同的方法制备高纯度ag3pz3。
[0138]
s2.将s1.2中制备得到的ag3pz3和水翁花提取物混合,得到ag3pz3和待测有机分子的共晶。收集所述共晶并进行单晶衍射。
[0139]
s2.1.将自然干燥的水翁[cleistocalyx operculatus(roxb.)merr.&perry]花50g,粉碎成粗粉,于室温下用甲醇超声提取三次,每次60分钟,合并提取液,减压浓缩得总
浸膏4.1g。总浸膏经甲醇溶解,上样于ods固相萃取柱(spe column)以移除不溶物以及色素、植物蜡等。萃取柱的流出液经真空泵减压浓缩,得到预处理的水翁花提物3.8g。
[0140]
称取s1中所得的高纯度ag3pz
3 130mg,并溶解于二氯甲烷-甲醇混合溶液(体积比2:1)中,随后加入水翁花粗提物13mg。将混合溶液过滤,随后转移到一个带帽的玻璃小瓶(体积:24ml)。在玻璃小瓶顶部插入一根针管以控制溶剂挥发速率。将玻璃小瓶置于避光条件下于室温进行缓慢的溶剂挥发,待溶剂挥发完全时(约6

7天),瓶底出现大量晶体。
[0141]
s2.2.挑选s2.1中所得晶面良好、大小适合,且晶胞参数不同于ag3pz3的晶体进行单晶x射线衍射分析,得到4个共晶ag3pz3·
1、ag3pz3·
2、ag3pz3·
3和ag3pz3·4·
5。
[0142]
采用与实施例1中s3相同的方法解析4个共晶ag3pz3·
1~ag3pz3·4·
5的晶体结构。
[0143]
ag3pz3·
1~ag3pz3·4·
5的晶体结构见图8

11,其晶体学衍射数据和结构精修的部分参数见表7和表8。
[0144]
表7.ag3pz3·
1和ag3pz3·
2的晶体学数据
[0145]
[0146][0147]
表8.ag3pz3·
3和ag3pz3·4·
5的晶体学数据
[0148][0149]
混合样品或天然提取物往往包含多个有机分子,对于混合样品或天然提取物中有
机分子的结构鉴定通常是先采用硅胶、大孔树脂、高效液相等色谱方法对有机化合物进行分离,得到各个化合物单体;然后对每个化合物单体,分别采用红外、紫外、质谱、核磁等波谱技术去解析化合物结构。
[0150]
而本发明的方法,无需经历繁琐的色谱分离和波谱分析过程,即可直接从水翁花的提取物中鉴定出5个化合物的化学结构,分别为6-formyl-7-hydroxy-5-methoxy-8-methylflavanone(1)、desmosflavanone ii(2)、3
′‑
formyl-4

,6
′‑
dihydroxy-2
′‑
methoxy-5
′‑
methylchalcone(3)、2

,4
′‑
dihydroxy-6
′‑
methoxy-3

,5
′‑
dimethylchalcone(4)和4

,6
′‑
dihydroxy-3
′‑
(methoxymethyl)-2
′‑
methoxy-5
′‑
methylchalcone(5),其化学结构如式依次为:
[0151][0152]
以上仅为本发明的实施例而已,并不用于限制本发明,凡在本发明的精神和原则之内,所做的任何修改、等同替换、改进等,均包含在申请待批的本发明的权利要求范围之内。

技术特征:
1.一种吡唑环三核银(i)配合物在有机分子结构测定中的应用。2.根据权利要求1所述应用,其特征在于:所述吡唑环三核银(i)配合物为3,5-双三氟甲基吡唑环三核银(i)配合物,化学式为ag3[3,5-(cf3)2pz]3,结构如式i所示:3.一种有机分子结构测定的方法,其特征在于,包括以下步骤:将吡唑环三核银(i)配合物与待测样品混合,得到吡唑环三核银(i)配合物和待测样品中有机分子的共晶,并对所述共晶进行单晶衍射分析,获得所述共晶的晶体衍射数据;根据共晶的晶体衍射数据,解析晶体结构,从而获得待测有机分子的化学结构和立体构型。4.根据权利要求3所述有机分子结构测定的方法,其特征在于:所述吡唑环三核银(i)配合物为3位和/或5位取代的吡唑环三核银(i)配合物。5.根据权利要求3所述有机分子结构测定的方法,其特征在于,所述根据共晶的晶体衍射数据,解析晶体结构,具体包括以下步骤:采用直接法确定部分非氢原子的位置,然后使用差值函数法和最小二乘法得到所有非氢原子的坐标;得到所有非氢原子的坐标后,进一步指认原子种类和结构精修,并用理论加氢的方法得到所有氢原子的坐标。6.根据权利要求3所述有机分子结构测定的方法,其特征在于:将吡唑环三核银(i)配合物与待测样品在有机溶剂中混合后,在避光条件下,对吡唑环三核银(i)配合物与待测有机分子的共晶进行培养;所述共晶培养的温度为-25℃~150℃。7.根据权利要求6所述有机分子结构测定的方法,其特征在于:所述吡唑环三核银(i)配合物和待测样品混合的摩尔比为1:10~10:1。8.根据权利要求6所述有机分子结构测定的方法,其特征在于:所述有机溶剂为甲醇、乙醇、乙腈、二氯甲烷、三氯甲烷、环己烷、石油醚、丙酮、乙醚、苯、乙酸乙酯、甲苯、异丙醇、1,4-二氧六环中的一种或多种。9.根据权利要求3所述有机分子结构测定的方法,其特征在于:所述单晶衍射分析的温度为-173℃~室温。10.根据权利要求3所述有机分子结构测定的方法,其特征在于:采用溶剂挥发法、溶剂扩散法、气相扩散法、溶剂热法中的一种获得共晶。

技术总结
本发明公开了一种吡唑环三核银(I)配合物在有机分子结构测定中的应用,特别是3,5-双三氟甲基吡唑环三核银(I)配合物在有机分子结构测定中的应用,具体包括以下步骤:合成吡唑环三核银(I)配合物;将吡唑环三核银(I)配合物与待测样品混合,得到吡唑环三核银(I)配合物和待测有机分子的共晶并进行单晶衍射分析,收集所述共晶的晶体数据;根据共晶的衍射数据解析晶体结构,从而获得待测有机分子的化学结构和立体构型。本发明可用于一系列非晶态化合物以及混合物样品的分子结构测定。及混合物样品的分子结构测定。及混合物样品的分子结构测定。


技术研发人员:李丹 叶文才 陆伟刚 王英 宋建国
受保护的技术使用者:暨南大学
技术研发日:2023.06.25
技术公布日:2023/9/6
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